本系以培育具跨域創新及專業能力的醫學工程專業人才為目標，為南台灣第一所生物醫學工程學系。因應國家政策未來趨勢及醫療器材產業發展之需求，規劃生醫電子暨醫學資訊、生醫材料暨組織工程、生物力學暨福祉科技特色領域課程，配合義大醫療財團法人之設備與臨床師資，訓練培育具有跨域整合創新能力之醫學工程專業人才，並規劃校外實習課程以提升學生就業競爭力。
本系以「因應未來醫療產業之發展需求，培育醫工專業職能人才」為宗旨，結合工程技術與臨床醫學需求，發揮相輔相成的效益，以造福社會。在AI科技時代的因應發展下，積極導入人工智慧技術於課程活動中，培養學生掌握智慧醫療與先進醫工應用能力。生醫產業屬高附加價值且高度創新的知識密集產業，本系畢業生每年皆有相當比例進入國立大學研究所深造，並在各大醫學中心醫工部門及醫療器材產業展現卓越表現，充分體現本系辦學品質與人才培育成果。
歡迎對生醫產業有憧憬、有熱情的妳/你加入義守大學生物醫學工程學系的大家庭！
生物醫學工程學系是唯一具有整合生物醫學科技、工程技術與臨床應用而形成之跨領域科系，其發展目的在於：
01
一、創新臨床醫學診斷、治療裝置或方法的開發。
02
二、創新醫療器材研發及改良，開發確效驗證作業的評估及執行。
03
三、醫療器材全球行銷、智財佈局與管理法規。
04
四、從事生物醫療的研究與發展，以增進全體人類的福祉。
1998 年 (民國 87 年)
生物醫學工程系成立，隸屬「電機資訊學院」，以培育醫學工程師、臨床工程師及研發工程師為目標。
2004 年 (93 學年度)
正式成立並招收碩士班。
99 學年度
隸屬學院由「電機資訊學院」更名改隸為「醫學院」。
110 學年度
隸屬學院由「醫學院」改隸為「醫學科技學院」。
大學部概况
成立年份
西元 1998 年
授予學位
工學學士
畢業生首屆
西元 2002 年
修業年限
4 年
畢業總學分
128 學分
碩士班概况
成立年份
西元 2004 年
授予學位
工學碩士
畢業生首屆
西元 2006 年
修業年限
1-4 年
畢業總學分
30 學分